巨幼红细胞性贫血主要是由于缺乏维生素B₁₂或叶酸引起的。正常人体内维生素B₁₂储备量一般可维持3~5年，叶酸储备量约为1~4个月，当摄入不足或吸收利用出现问题时就会发病。
一、叶酸缺乏的原因
1.摄入不足： 长期偏食、节食的人容易出现叶酸摄入不足。比如一些人只爱吃精米白面，而新鲜蔬菜、水果、肉类中叶酸含量丰富，长期缺乏这类食物供应，就可能导致叶酸摄入不够。孕妇如果孕期饮食中叶酸摄取不足，也会增加胎儿发生巨幼红细胞性贫血的风险。2.吸收障碍： 某些胃肠道疾病会影响叶酸的吸收，像慢性腹泻、小肠疾病（如克罗恩病等），会使叶酸在肠道的吸收功能受损，从而导致体内叶酸缺乏。另外，长期服用一些药物也可能干扰叶酸吸收，例如长期服用抗癫痫药，可能影响叶酸的代谢与吸收。
二、维生素B₁₂缺乏的原因
1.摄入不足： 严格素食者容易缺乏维生素B₁₂，因为维生素B₁₂主要存在于动物性食物中，如肉类、蛋类、奶制品等，素食者长期不摄入这类食物，就会导致维生素B₁₂摄入不足。老年人如果牙齿不好，饮食过于单一，也可能出现维生素B₁₂摄入不足的情况。2.吸收障碍： 内因子缺乏是导致维生素B₁₂吸收障碍的常见原因，常见于恶性贫血患者，患者体内缺乏内因子，使得维生素B₁₂无法在肠道正常吸收。一些胃肠道手术患者，比如胃大部切除术患者，会影响维生素B₁₂的吸收部位，导致吸收减少。另外，肠道寄生虫感染也可能影响维生素B₁₂的吸收，寄生虫会与人体竞争营养物质，干扰维生素B₁₂的正常吸收过程。
三、其他相关因素
1.需求增加： 婴儿生长发育迅速时对叶酸和维生素B₁₂的需求增加，如果没有及时补充，就容易发生巨幼红细胞性贫血。妊娠期女性由于胎儿生长发育以及自身血容量增加等原因，对叶酸和维生素B₁₂的需求也会增多，若摄入不足就易发病。2.药物影响： 某些药物会干扰叶酸或维生素B₁₂的代谢。例如，甲氨蝶呤等抗肿瘤药物会抑制二氢叶酸还原酶，影响叶酸的代谢利用；对氨基水杨酸、苯巴比妥、苯妥英钠等药物可能影响维生素B₁₂的吸收或代谢过程，长期服用这些药物的人群需要密切关注是否出现巨幼红细胞性贫血的情况。