眼睛酸痛流眼泪的治疗方法包括物理治疗、使用药物以及手术。具体如下：
一、物理治疗：
1.当眼睛因用眼过度而出现酸痛流眼泪，且无其他不适时，应让眼睛充分休息，可闭目养神。
2.还能通过用热毛巾敷于眼部，或者轻轻按摩眼部，这样可以促进眼部血液循环，对于缓解眼睛酸痛流泪能起到一定作用。
二、使用药物：
1.若眼睛酸痛流眼泪是由炎症引起，可在医生指导下使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等药物进行治疗。
2.如果是过敏性结膜炎导致的，可遵医嘱使用普拉洛芬滴眼液、富马酸依美斯汀滴眼液等进行治疗。
三、手术：
1.对于倒睫导致的眼睛酸痛流眼泪，可在医生指导下通过用镊子拔除倒着长的睫毛，或者采用激光去除的方式，必要时可施行睑内翻矫正术进行治疗。
总之，当出现眼睛酸痛流眼泪的情况时，要根据具体病因选择合适的治疗方法。