直肠粘膜脱垂的治疗方式主要有非手术治疗和手术治疗等。一般来说，对于轻度的直肠粘膜脱垂，非手术治疗可能是首先考虑的方式。
非手术治疗
一般治疗：
饮食调整： 患者应增加膳食纤维的摄入，每天保证摄入20~30克左右的膳食纤维，多吃蔬菜（如芹菜、菠菜等）、水果（如香蕉、苹果等）和全谷类食物，保持大便通畅，避免便秘，因为便秘可能会加重直肠粘膜脱垂的症状。排便习惯训练： 养成良好的排便习惯，每天定时排便，尽量缩短排便时间，一般控制在5分钟以内，避免长时间蹲厕。
注射治疗：
硬化剂注射： 常用的硬化剂有5%石炭酸植物油等。通过将硬化剂注射到直肠粘膜下或直肠周围，使粘膜与肌层粘连固定。一般适用于儿童轻中度的直肠粘膜脱垂，但可能存在复发的情况，部分患者可能需要多次注射。
手术治疗
经肛门手术：
直肠粘膜环切术： 适用于直肠粘膜脱垂较严重的成人患者。通过切除脱垂的直肠粘膜，然后进行吻合，以纠正脱垂。该手术创伤相对较小，但需要严格掌握适应证，术后需要注意观察有无出血、感染等并发症。肛门环缩术： 用金属线或硅胶环置于皮下，使肛门缩小，阻止直肠粘膜脱垂。适用于年老体弱或伴有严重疾病不能耐受较大手术的患者，但该方法效果可能有限，且有一定的复发风险。
经腹手术：
直肠悬吊固定术： 是治疗直肠粘膜脱垂较为有效的手术方法之一。通过将直肠固定在骶骨前的组织上，加强直肠的支持。适用于重度的直肠粘膜脱垂患者，手术相对复杂，对医生的技术要求较高，术后需要注意休息和护理，防止并发症的发生。