软疣的治疗方法有多种，一般可以通过局部治疗等方式来处理。比如对于较小的软疣，可采用局部消毒后用镊子将软疣小体挤出，然后外涂碘酊等进行处理。
局部治疗方法
疣体夹除术：这是治疗软疣比较常用的方法，医生会用消毒的镊子等工具直接将软疣的疣体夹除，操作时要注意彻底夹除软疣小体，之后局部可以涂抹碘伏等进行消毒，预防感染。一般一次夹除可能不够，可能需要多次操作。冷冻治疗：利用低温的液氮等使软疣组织坏死脱落。冷冻治疗时可能会有一定的疼痛感，治疗后局部可能会出现水疱等情况，要注意保持局部清洁干燥，避免感染，一般经过1 - 2次冷冻治疗可能会使软疣消退。
药物辅助治疗
外用药物：对于一些不宜采用夹除术的患者，可以使用外用药物，比如维A酸软膏等。维A酸软膏可以调节上皮细胞的生长和分化，对软疣可能有一定的治疗作用，但起效相对较慢，需要坚持使用一段时间。不过使用维A酸软膏时要注意避免接触正常皮肤，以免引起刺激。
注意事项
避免搔抓：患者要注意不要搔抓软疣部位，以免导致自身接种，使软疣扩散到身体其他部位，造成更多的皮损。个人卫生：要注意保持皮肤清洁，勤换衣物，尤其是贴身的衣物要定期清洗消毒，避免与他人共用毛巾、衣物等，防止传染给他人。免疫力方面：对于免疫力较低的人群，比如患有艾滋病等免疫缺陷疾病的患者，软疣可能更容易复发或者病情较难控制，这类人群除了针对软疣进行治疗外，还需要积极治疗基础疾病，提高自身免疫力。