肛裂主要的症状有疼痛，这种疼痛通常比较剧烈，呈周期性，一般排便时会出现疼痛，便后有短暂缓解，之后又会出现剧烈疼痛，可持续数小时。另外，便血也是常见症状，便血的量一般较少，鲜血多附着在粪便表面或便纸上。还有一个症状是便秘，很多肛裂患者因为害怕排便时的疼痛，有意推迟排便时间，导致粪便在肠道内停留时间过长，水分被过度吸收，变得干结，进一步加重肛裂症状，形成恶性循环。
疼痛特点：
排便时疼痛： 排便时干硬的粪便通过肛管，会刺激受损的黏膜，立刻引起肛门烧灼样或刀割样疼痛，称为排便时疼痛。一般持续数分钟后可缓解，此为疼痛间歇期。便后疼痛： 排便后数分钟到十余分钟，因肛门括约肌收缩痉挛，又会产生剧烈疼痛，可持续数小时，直到括约肌疲劳松弛后，疼痛才会缓解。
便血表现：
出血量少： 便血的量通常比较少，一般是粪便表面带血，或者便纸上有少量鲜血。这是因为肛裂创面较小，出血量不多。鲜血为主： 血液颜色鲜红，这是由于肛裂是肛管皮肤的裂伤，出血来自于裂伤处的小血管破裂。
便秘情况：
主动抑制排便： 很多肛裂患者因为在排便时经历了剧烈的疼痛，所以会有意识地控制排便，长时间不排便。粪便干结： 长时间不排便，粪便在肠道内停留过久，水分被重吸收，导致粪便干结，更加粗硬，再次排便时就会更加容易损伤肛管皮肤，加重肛裂。而且干结的粪便会使排便更加困难，形成便秘 - 肛裂 - 便秘的恶性循环。