骨髓炎主要是由细菌感染引起的，其中金黄色葡萄球菌是常见的致病菌。一般来说，约50%的慢性骨髓炎患者是由金黄色葡萄球菌导致的。
创伤相关感染引发
开放性骨折导致： 当发生开放性骨折时，骨折部位与外界相通，细菌很容易侵入。比如一些严重的交通事故造成的骨折，伤口直接暴露在环境中，细菌就有机会进入骨骼周围组织，引发骨髓炎。骨折后如果伤口处理不及时、不彻底，也会增加感染风险。手术后感染： 像骨科手术之后，比如关节置换手术等，如果术后伤口护理不当，或者患者自身抵抗力下降，细菌就可能在手术部位滋生，进而感染骨髓。有数据显示，骨科手术后发生骨髓炎的概率大约在1% - 5%左右。
血源性感染所致
身体其他部位感染蔓延： 当人体其他部位有感染病灶时，细菌可能通过血液循环到达骨骼。例如，皮肤疖肿、扁桃体炎等感染，细菌随着血液流动，到达骨骼部位。儿童时期发生血源性骨髓炎的几率相对较高，因为儿童的骨骺板附近的微小终末动脉与毛细血管往往更为弯曲，容易使细菌栓塞，从而引发感染。免疫力低下人群易患： 本身免疫力低下的人，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病的患者，身体抵御细菌的能力减弱，更容易受到血源性感染引发骨髓炎。糖尿病患者由于血糖控制不佳，局部组织抵抗力下降，一旦有细菌入侵，就更易导致骨髓感染。
临近感染灶蔓延而来
软组织感染波及： 邻近骨骼的软组织发生感染，如果没有得到及时有效的控制，感染可能会向骨骼蔓延。比如足部的甲沟炎，如果感染加重，细菌可能会沿着组织间隙向周围骨骼扩散，引发骨髓炎。牙科感染影响： 牙齿周围的感染，像牙周炎等，如果病情发展，细菌也有可能侵犯到颌骨，导致颌骨骨髓炎。尤其是一些慢性牙周炎患者，长期的炎症刺激容易使细菌向周围组织包括颌骨扩散。