口腔溃疡的引发原因有多种。一般来说，约20% - 30%的口腔溃疡与遗传因素有关，如果父母双方都有复发性口腔溃疡，子女患病几率可高达60% - 70%。
一、局部创伤因素
口腔内机械刺激： 牙齿残根、残冠边缘锋利，或者佩戴不合适的假牙，长时间摩擦口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡。比如有尖锐牙尖的人，吃硬物时就可能被刺伤，进而形成溃疡。咬伤口腔黏膜： 吃饭时不小心咬伤口腔内侧黏膜，若未及时处理，也会发展成口腔溃疡。这种情况在儿童中较为常见，孩子吃饭速度快或咀嚼不充分时容易发生。
二、营养缺乏因素
维生素缺乏： 缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、B6等，会影响口腔黏膜的正常代谢，增加口腔溃疡发生的概率。比如长期吃素、饮食不均衡的人，就容易出现这类维生素缺乏的情况。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体多种酶的合成，缺乏时会影响细胞修复；铁是合成血红蛋白的重要原料，缺乏铁会导致免疫力下降，从而容易引发口腔溃疡。
三、免疫系统因素
自身免疫反应： 当人体免疫系统出现异常时，会错误地攻击自身的口腔黏膜组织，引发口腔溃疡。例如患有白塞病的患者，口腔溃疡往往是其典型症状之一，同时还可能伴有眼部、生殖器等部位的病变。免疫力低下： 当人体免疫力降低时，如感冒、过度疲劳、睡眠不足等情况下，口腔内的潜在病菌就容易活跃起来，导致口腔溃疡发作。比如换季时，很多人因免疫力暂时下降而长口腔溃疡。