口腔溃疡的引发原因较多，比如约20%的人是因遗传因素易长口腔溃疡，父母双方都有复发性口腔溃疡的，子女发病率能达60%~70%。
局部创伤因素
口腔咬伤：吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就可能形成口腔溃疡，比如咀嚼过快、说话时不小心咬到等情况都容易发生。牙刷划伤：使用过硬的牙刷或刷牙时用力过猛，会划伤口腔黏膜，进而引发口腔溃疡。
营养缺乏因素
维生素缺乏：当人体缺乏维生素B₂、维生素B₁₂、叶酸等维生素时，容易出现口腔溃疡。比如长期吃素的人，如果饮食搭配不合理，就较易缺乏这些维生素。微量元素缺乏：像锌、铁等微量元素缺乏也和口腔溃疡有关。例如一些节食减肥的人，饮食摄入不均衡，就可能导致微量元素缺乏引发口腔溃疡。
免疫系统因素
自身免疫反应：当人体免疫系统出现紊乱时，会攻击自身的口腔黏膜组织，从而引发口腔溃疡。比如患有自身免疫性疾病的人，如白塞病患者，口腔溃疡是常见症状之一，且容易反复发作。免疫力低下：当人体免疫力低下时，比如感冒发烧、过度劳累后，身体抵御病菌的能力下降，就容易被病菌侵袭引发口腔溃疡，一般这种情况多发生在身体比较疲惫的时候。