慢性肠炎的症状主要有这些：一般来说，患者会出现长期反复的腹泻，病程可能持续数月甚至数年，每天腹泻次数可能在3 - 5次不等，严重的可能超过10次。
肠道症状表现
腹痛情况： 多数患者会有腹痛症状，疼痛部位多在腹部中下部，一般为隐痛或胀痛，疼痛程度轻重不一，有的患者疼痛比较轻微，仅在进食后有腹部不适感，有的则疼痛较为明显，在空腹时也可能出现疼痛。腹泻特征： 除了频繁腹泻外，粪便性状也有变化，可能表现为糊状便、稀水样便，部分患者粪便中还可能含有黏液，严重时会出现脓血便，但脓血量一般相对较少。
全身伴随症状
营养不良表现： 由于肠道长期吸收功能受影响，患者可能出现体重减轻，一般在几个月内体重可下降5 - 10斤不等，还可能伴有乏力、疲倦等症状，因为营养物质吸收不良，身体缺乏必要的能量供应来源。发热情况： 部分慢性肠炎患者会出现低热，体温一般在37.5℃ - 38℃之间，少数病情较重的患者可能出现中度发热，体温可达38.5℃左右，但这种发热一般不是持续性高热。
其他相关症状
消化不良现象： 患者常伴有消化不良，表现为食欲减退，对食物的摄取量明显减少，尤其是对油腻、不易消化的食物更易出现恶心、呕吐等不适，进食后腹胀感较为明显，感觉食物在胃内长时间不消化。肠道功能紊乱表现： 还可能出现肠道功能紊乱的情况，比如便秘与腹泻交替出现，一段时间是腹泻为主，过一段时间又变为便秘，排便时间也不规律，有的患者早上起床后有便意，有的则是在进食后出现便意。