肠胃型感冒主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒，约占引发肠胃型感冒病毒的一部分。
病毒感染是主因
柯萨奇病毒作祟： 柯萨奇病毒分为A组和B组，其中A组的某些亚型以及B组的部分亚型容易引发肠胃型感冒，它会入侵人体消化道等部位，导致肠胃出现不适症状。其他病毒参与： 像埃可病毒也可能引发肠胃型感冒，它同样会在人体肠道内繁殖，影响肠胃的正常功能，引起恶心、呕吐、腹泻等肠胃相关症状。
自身抵抗力影响
免疫力低下时易中招： 当人体自身免疫力较低的时候，比如长期睡眠不足、过度劳累后，身体抵御病毒的能力下降，就更容易被引发肠胃型感冒的病毒侵袭。一般来说，长期熬夜的人相比作息规律的人，肠胃型感冒的发病风险会高一些。儿童更需关注： 儿童的免疫系统还在发育阶段，相对成人来说免疫力更弱，所以儿童患肠胃型感冒的几率比成人要高，尤其是6个月 - 2岁的婴幼儿，由于自身免疫功能不完善，更容易被病毒感染引发肠胃型感冒。
外界环境因素作用
气温突变易触发： 当气温在短时间内发生较大变化时，比如突然降温，人体的肠胃功能会受到影响，这时候病毒就容易趁虚而入引发肠胃型感冒。例如在季节交替的时候，气温波动较大，肠胃型感冒的发病率会有所升高。接触感染源传播： 如果接触了患有肠胃型感冒的患者，通过飞沫传播或者接触被病毒污染的物品等方式，也容易被感染。比如在人群密集的公共场所，像超市、学校等地方，一旦有患者存在，就增加了他人感染病毒引发肠胃型感冒的风险。