肠胃性感冒主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒，约占引发肠胃性感冒病毒的一半左右。
病毒感染因素
柯萨奇病毒感染： 柯萨奇病毒通过消化道或呼吸道侵入人体，当人体免疫力下降时，就容易被这种病毒侵袭。比如在人群密集的场所，像学校、医院等，柯萨奇病毒很容易在人与人之间传播，一旦进入人体，就会影响胃肠道功能，导致肠胃性感冒发生。埃可病毒感染： 埃可病毒也是引发肠胃性感冒的常见病毒之一。它同样可以通过粪 - 口途径传播，比如食用了被埃可病毒污染的食物或水，就可能感染发病。这种病毒会在肠道内繁殖，引起肠道炎症反应，同时影响胃肠道的正常蠕动和消化功能，从而出现肠胃性感冒的一系列症状。
环境因素影响
气温变化： 当气温突然降低时，人体的免疫力可能会受到影响。例如在季节交替的时候，早晚温差较大，如果没有及时增减衣物，就容易患上肠胃性感冒。研究发现，在气温骤降的时间段内，肠胃性感冒的发病率会明显升高。潮湿环境： 长期处于潮湿的环境中，也容易引发肠胃性感冒。潮湿的环境有利于病毒的存活和传播，人体长时间暴露在这样的环境里，呼吸道和胃肠道的抵抗力会下降，增加了感染病毒引发肠胃性感冒的风险。比如一些地下室或者长期不通风、比较潮湿的居住环境，就可能成为病毒滋生的温床。
自身免疫力因素
儿童免疫力低： 儿童的免疫系统还没有完全发育成熟，相比成年人更容易受到病毒的侵袭。例如3岁以下的儿童，自身产生的抗体较少，对柯萨奇病毒、埃可病毒等的抵御能力较弱，所以肠胃性感冒在儿童群体中较为常见。老年人免疫力衰退： 随着年龄的增长，老年人的免疫力会逐渐衰退。老年人的胃肠道功能也会减弱，这使得他们在面对病毒感染时，更容易患上肠胃性感冒。比如60岁以上的老年人，由于身体各项机能的下降，感染肠胃性感冒后恢复的时间也可能比年轻人更长。