13岁女孩月经只来一天就没有了，可能是正常生理现象。因为青春期女孩的下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴尚未完全成熟，激素分泌不稳定，月经初潮后的1 - 2年内，约有40%的女孩月经周期不规律，月经量也可能不稳定，有的可能出现月经经期短，比如最初几次月经可能持续时间较短，像1 - 2天就结束。
生理发育因素
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴未成熟： 青春期女孩的下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴处于逐渐完善的过程中。在这个阶段，激素的分泌调节还不太稳定，会影响子宫内膜的生长和脱落。例如，促性腺激素释放激素、促性腺激素等的分泌脉冲式变化不规律，导致子宫内膜的增生和脱落不能很好地协调，就可能出现月经经期短的情况。子宫内膜较薄： 由于内分泌调节的不稳定，子宫内膜的生长相对较薄。在月经来潮时，子宫内膜脱落较少，所以月经持续时间短。一般随着年龄增长，身体发育成熟，子宫内膜会逐渐正常增厚，月经经期也会恢复正常。
生活方式影响
压力过大： 13岁女孩可能面临学习等方面的压力，长期精神紧张、压力大可能影响内分泌。比如学习负担重，经常处于焦虑状态，会干扰下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，进而影响月经。如果能适当减轻压力，保持轻松的心态，月经情况可能会改善。过度劳累： 过度的体力劳动或者熬夜等都会影响身体的正常代谢和内分泌。例如，经常熬夜会打乱生物钟，影响激素的正常分泌节律，从而对月经产生不良影响。保证充足的睡眠，合理安排作息时间，有助于月经恢复正常规律。
疾病相关因素
多囊卵巢综合征： 虽然多见于育龄女性，但青春期女孩也可能患病。多囊卵巢综合征会导致雄激素水平升高，影响排卵，进而引起月经紊乱，可能出现月经经期短、月经量少等情况。不过这种情况相对较少见，如果怀疑有该疾病，需要就医进行相关检查，如激素水平测定、B超检查等。甲状腺功能异常： 甲状腺分泌的激素对身体的代谢和内分泌调节有重要作用。甲状腺功能减退或亢进都可能影响月经。甲状腺功能减退会使身体代谢减慢，激素分泌异常，从而影响月经周期和经期；甲状腺功能亢进则会使代谢加快，也可能导致月经紊乱。需要通过甲状腺功能检查来明确是否存在异常。