同房后有时候小便时尿道刺痛，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，多由细菌感染引起。除了尿道刺痛，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，要注意多喝水，多排尿，有助于缓解症状和促进恢复。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也可能导致小便时尿道刺痛。此外，还可能出现尿频、尿急、尿痛等症状，部分患者可能伴有血尿。膀胱炎的治疗方法与尿道炎类似，常用药物包括头孢呋辛酯、磺胺嘧啶等。
3.前列腺炎：男性患者如果患有前列腺炎，在同房后也可能出现尿道刺痛的症状。还可能伴有会阴部、耻骨上区疼痛，尿频、尿急、尿痛，排尿困难等。前列腺炎的治疗需要综合考虑病因、病情严重程度等因素，治疗方法包括药物治疗（如抗生素、α受体阻滞剂等）、物理治疗（如前列腺按摩、热敷等）等。
4.其他原因：尿道结石、尿道损伤、尿道口息肉等也可能导致同房后尿道刺痛。此外，女性患者如果患有阴道炎、宫颈炎等妇科炎症，炎症可能逆行感染尿道，导致尿道刺痛。
如果出现同房后尿道刺痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免憋尿，多喝水，多排尿，有助于预防尿道感染。此外，在治疗期间应避免同房，以免加重病情或导致交叉感染。