细菌性阴炎主要是阴道内正常菌群失调引起的混合感染，其中厌氧菌居多，约占60%~70%。
阴道菌群失衡因素
性生活方面：多个性伴侣或者频繁更换性伴侣，会增加阴道菌群失调的风险，因为不同人的阴道菌群可能不同，容易打破自身阴道的菌群平衡。另外，性生活过于混乱，还可能引入其他病原体，破坏阴道正常的微生态环境。卫生习惯问题：过度清洁阴道是常见诱因之一。比如频繁使用阴道洗液冲洗，正常情况下阴道有自净作用，频繁冲洗会破坏阴道原有的酸性环境，使得有益菌减少，有害菌容易滋生。一般建议每天用清水清洗外阴即可，不要随意冲洗阴道内部。还有，穿着紧身不透气的内裤，会使阴道局部温度和湿度升高，有利于细菌繁殖，增加患细菌性阴炎的几率。
妇科手术影响
流产手术：女性进行人工流产手术时，宫腔操作可能会损伤宫颈和子宫内膜，使阴道的自然防御功能受到破坏，细菌容易入侵引发感染。据统计，有过流产史的女性患细菌性阴炎的概率比没有流产史的女性要高一些。宫腔手术：像放置宫内节育器等宫腔手术，在操作过程中如果消毒不严格或者术后护理不当，也可能导致细菌感染，引发细菌性阴炎。手术会对宫腔造成一定的创伤，为细菌的侵入提供了机会，如果术后不注意个人卫生，感染的风险会进一步增加。
其他相关因素
糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖较高，阴道内糖原含量也会升高，适合厌氧菌等细菌生长繁殖，所以糖尿病患者患细菌性阴炎的可能性比正常人高。研究发现，糖尿病患者中约有一定比例容易出现细菌性阴炎的情况，控制血糖对于预防细菌性阴炎很重要。长期使用抗生素：长期大量使用抗生素会抑制阴道内有益菌的生长，比如抑制乳酸杆菌的生长，使得阴道内菌群失衡，从而容易引发细菌性阴炎。当广谱抗生素大量使用时，它在杀灭有害菌的同时，也会破坏阴道内的正常菌群平衡，给厌氧菌等机会大量繁殖。