上厕所小便疼，可能与以下原因有关：
1.尿路感染：如尿道炎、膀胱炎等，多由细菌感染引起。常伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。可通过尿常规等检查明确诊断，治疗通常使用抗生素。
2.尿路结石：如膀胱结石、输尿管结石等，可导致尿路堵塞，排尿不畅，引起疼痛。疼痛通常较为剧烈，还可能伴有血尿。B超或X线检查有助于诊断，较小的结石可通过多饮水、多运动自行排出，较大的结石可能需要体外冲击波碎石或手术治疗。
3.前列腺炎或前列腺增生：男性患者中较为常见，可引起排尿困难，导致小便疼。此外，还可能伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。前列腺液常规、超声等检查有助于诊断，治疗方法包括药物治疗、物理治疗、手术治疗等。
4.其他原因：尿道口炎、膀胱癌、尿道狭窄等也可能导致上厕所小便疼。
总之，上厕所小便疼的原因较为复杂，需要结合具体情况进行分析。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。此外，保持良好的个人卫生习惯，多饮水、勤排尿，对预防尿路疾病也有一定帮助。