上厕所小便疼，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是泌尿系统最常见的疾病。女性患者多见，临床上分为急性和慢性、非特异性尿道炎和淋菌性尿道炎。多表现为尿频、尿急、尿痛，有时伴有血尿。尿道炎的发生与局部感染、免疫力下降等因素有关。如果是急性尿道炎，还可能出现发热等全身症状。
2.膀胱炎：膀胱炎是一种常见的尿路感染性疾病，约占尿路感染总数的50%至70%。因细菌感染而引起。其致病菌多数为大肠杆菌。膀胱炎最典型的症状是尿频、尿急、尿痛甚至有急迫性尿失禁，可以有血尿和脓尿。
3.前列腺炎：前列腺炎是成年男性的常见病之一。虽然它不是一种直接威胁生命的疾病，但严重影响患者的生活质量。前列腺炎是指由多种复杂原因引起的，以尿道刺激症状和慢性盆腔疼痛为主要临床表现的前列腺疾病。前列腺炎的症状表现为尿频、尿急、尿痛、尿不尽、尿等待、尿滴沥、尿分叉、尿道口脓性分泌物等。
4.前列腺增生：前列腺增生是老年男性常见疾病之一，随全球人口老年化发病日渐增多。前列腺增生的早期由于代偿，症状不典型，随着下尿路梗阻加重，症状逐渐明显，临床症状包括储尿期症状，排尿期症状以及排尿后症状。由于病程进展缓慢，难以确定起病时间。
5.泌尿系统结石：泌尿系统结石是泌尿系统各部位结石病的总称，是泌尿系统的常见病。根据结石所在部位的不同，分为肾结石、输尿管结石、膀胱结石、尿道结石。结石可能刺激尿路黏膜，导致局部损伤，出现疼痛、血尿等症状。
6.其他：其他原因如尿道口狭窄、膀胱肿瘤、膀胱癌等也可能导致小便疼痛。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要根据个人的症状、体征以及相关检查来确定。如果出现小便疼痛的症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，并根据病因进行相应的治疗。同时，保持良好的生活习惯，如多饮水、勤排尿、注意个人卫生等，有助于预防泌尿系统感染的发生。