小脑扁桃体下疝的疗法主要包括保守治疗和手术治疗等。一般来说，对于症状较轻且无进行性加重的患者可先尝试保守治疗，而症状明显或有进行性加重的多需手术干预。
保守治疗
药物对症治疗：
非甾体抗炎药：当患者出现头痛等症状时，可使用非甾体抗炎药来缓解疼痛，这类药物能通过抑制前列腺素合成发挥作用，但需注意长期使用可能有胃肠道不适等副作用，不过具体使用要在医生评估下进行。神经营养药物：比如甲钴胺等神经营养药物，可起到营养神经的作用，有助于改善因小脑扁桃体下疝可能导致的神经功能相关问题，但单独使用往往难以从根本上解决小脑扁桃体下疝的结构异常问题。
康复锻炼：
颈部康复锻炼：患者可进行适度的颈部伸展等简单康复锻炼，每天可进行数次，每次几分钟，但要注意运动幅度和力度，避免过度劳累加重病情。通过适当锻炼有助于维持颈部肌肉的力量和灵活性，可能对缓解一些相关不适有一定帮助，但不能替代针对疾病本身的有效治疗。
手术治疗
后颅窝减压术：
这是较为常用的手术方式，通过去除部分颅骨等结构，扩大后颅窝空间，减轻对小脑扁桃体等结构的压迫。手术通常需要在全身麻醉下进行，术后患者需要一定时间恢复，一般住院时间可能在1~2周左右，具体恢复时间因个体差异而异，有的患者可能需要数周甚至数月才能逐步恢复正常的神经功能等情况。
上颈椎减压融合术：
对于合并有上颈椎畸形等情况的小脑扁桃体下疝患者，可能需要进行上颈椎减压融合术，通过对颈椎部位进行处理，解除对神经等结构的压迫并稳定颈椎。手术风险相对较高，术后需要严格遵循医生的康复指导进行颈部的护理和康复，例如术后短期内要避免剧烈活动颈部，按照医生安排进行适当的颈部固定等措施来促进恢复。总之，小脑扁桃体下疝的具体疗法要根据患者的具体病情、身体状况等多方面因素由医生综合评估后制定个体化的治疗方案。