新生儿筛查主要检查以下几种疾病：
1.先天性甲状腺功能减退症：由于甲状腺激素分泌不足，会影响宝宝的生长发育，导致智力低下等问题。通常在新生儿出生后3天至7天内进行足跟采血，检测促甲状腺激素（TSH）水平。如果怀疑有先天性甲状腺功能减退症，需要进一步进行甲状腺功能检查。
2.苯丙酮尿症：是一种常染色体隐性遗传代谢病，由于苯丙氨酸羟化酶活性缺乏，导致苯丙氨酸代谢异常，蓄积在体内，对神经系统造成损害。一般在新生儿出生后3天至7天内进行足跟采血，检测苯丙氨酸浓度。如果怀疑有苯丙酮尿症，需要进一步进行苯丙氨酸负荷试验和相关基因检测。
3.先天性肾上腺皮质增生症：由于肾上腺皮质激素合成过程中所需酶的缺陷，导致肾上腺皮质分泌过多的雄激素，影响正常的发育和代谢。通常在新生儿出生后1个月内进行筛查，检测17-羟孕酮和皮质醇水平。如果怀疑有先天性肾上腺皮质增生症，需要进一步进行激素测定和基因检测。
4.葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症：俗称蚕豆病，是一种遗传性溶血性疾病，由于红细胞内缺乏葡萄糖-6-磷酸脱氢酶，导致红细胞容易破裂，引起贫血等症状。一般在新生儿出生后3天至7天内进行筛查，检测红细胞葡萄糖-6-磷酸脱氢酶活性。如果怀疑有葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症，需要进一步进行其他相关检查。
5.地中海贫血：是一种遗传性溶血性疾病，由于珠蛋白基因缺陷，导致血红蛋白合成异常，引起贫血等症状。一般在新生儿出生后3个月内进行筛查，检测血红蛋白电泳或基因分析。如果怀疑有地中海贫血，需要进一步进行确诊试验和遗传咨询。
需要注意的是，每个地区的新生儿筛查项目可能会有所不同，具体的筛查内容和时间可以咨询当地的医疗机构或妇幼保健院。此外，新生儿筛查只是一种初步的检查方法，不能完全排除所有的先天性疾病。如果在筛查中发现异常，需要及时进行进一步的诊断和治疗，以保障宝宝的健康。