吃饭喝水总是呛咳可能由多种原因引起。比如，正常老年人随着年龄增长，吞咽功能可能会有所减退，有研究显示约1/3的65岁以上老人存在不同程度的吞咽障碍，从而容易出现吃饭喝水呛咳的情况。
神经系统疾病导致
脑血管病变： 像脑梗死、脑出血等脑血管疾病，会损伤控制吞咽反射的神经中枢或神经通路。例如脑梗死患者中，约有40% - 60%会出现吞咽困难及呛咳症状，病变部位若在脑干等与吞咽密切相关的区域，更容易影响吞咽功能。帕金森病： 这是一种常见的神经系统退行性疾病，患者由于锥体外系功能障碍，会逐渐出现吞咽肌肉协调障碍。据统计，超过70%的帕金森病患者在疾病中晚期会发生吞咽困难，进而引发吃饭喝水呛咳。
吞咽相关肌肉问题
咽喉部肌肉病变： 重症肌无力是一种自身免疫性疾病，会累及神经 - 肌肉接头处，导致咽喉部肌肉无力。患者在进食时，会出现吞咽费力、容易呛咳的情况，而且症状具有波动性，晨轻暮重。环咽肌功能障碍： 环咽肌在吞咽过程中起到重要作用，若其出现功能异常，比如环咽肌不能正常松弛，就会影响食物通过。老年人由于环咽肌退变等原因，容易发生环咽肌功能障碍，进而引发呛咳。
其他原因
口腔疾病影响： 严重的牙周炎、口腔溃疡等口腔疾病，会使患者进食时疼痛，从而不敢正常吞咽，导致吃饭喝水时容易呛咳。比如患有严重牙周炎的患者，进食固体食物或液体时都会受到影响。食管疾病干扰： 食管癌患者在疾病进展到一定程度时，会出现食管狭窄，食物通过困难，也会引发呛咳。另外，贲门失弛缓症患者由于食管下括约肌松弛障碍，食物难以顺利进入胃内，也容易在进食时发生呛咳。