肾结石的形成原因较为复杂，可能与以下因素有关：
1.饮食因素：
草酸积存过多：体内草酸的大量积存，是导致肾尿结石的因素之一。如菠菜、豆类、葡萄、可可、茶叶、桔子、番茄、土豆、李子、竹笋等这些人们普遍爱吃的东西，正是含草酸较高的食物。
嘌呤代谢失常：动物内脏、海产食品、花生、豆角、菠菜等，均含有较多的嘌呤成分。嘌呤进入体内后，要进行新陈代谢，它代谢的最终产物是尿酸。尿酸可促使尿中草酸盐沉淀。如果，一次过多地食用了含嘌呤丰富的食物，嘌呤的代谢又失常，草酸盐便在尿中沉积而形成尿结石。
脂肪摄取太多：各种动物的肉类，尤其是肥猪肉，都是脂肪多的食品。多吃了体内脂肪必然增高，脂肪会减少肠道中可结合的钙，因而引起对草酸盐的吸收增多，如果一旦出现排泄功能故障，如出汗多、喝水少，尿量少，肾结石很可能就在这种情况下形成。
糖分增高：糖是人体的重要养分，要经常适量增补，但一下子增加太多，尤其是乳糖，也会使结石形成创造条件。专家们发现：不论正常人或结石病人，在食用100克蔗糖后，过2小时去检查他们的尿，发现尿中的钙和草酸浓度均上升，若是服用乳糖，它更能促进钙的吸收，更可能导致草酸钙在体内的积存而形成尿结石。
2.草酸钙结石：尿液中草酸钙的浓度过高，或是草酸钙的排泄量过多，都可能导致草酸钙结石的形成。
3.嘌呤代谢异常：嘌呤进入体内后，会代谢成尿酸，尿酸可促使尿中草酸盐沉淀。如果一次过多地食用了含嘌呤丰富的食物，嘌呤的代谢又失常，草酸盐便在尿中沉积而形成尿结石。
4.脂肪摄取太多：体内脂肪过多会减少肠道中可结合的钙，从而引起草酸盐的吸收增多，若出现排泄功能故障，就可能形成肾结石。
5.糖分增高：糖是人体的重要养分，但糖分摄入过多，尤其是乳糖，会使结石形成创造条件。
6.蛋白质过量：如果经常过量食用高蛋白质的食物，会使肾脏和尿中的钙、草酸、尿酸的成分普遍增高。如果不能及时有效地通过肾脏功能把多余的钙、草酸、尿酸排出体外，这样，得肾脏结石、输尿管结石症的条件就形成了。当今世界经济发达国家肾结石发病率增高的主要原因就是如此。
7.水质问题：有些地区的饮用水属于硬水，水中含钙、草酸、尿酸的成分都比较多，长期饮用这类硬水，就容易导致肾结石。
8.疾病因素：
甲状旁腺机能亢进：甲状旁腺激素可调节血钙水平，甲状旁腺机能亢进时，会引起血钙升高，导致尿钙排泄增加，容易形成肾结石。
肾小管酸中毒：肾小管酸中毒时，尿液酸化功能障碍，导致尿酸排泄增加，草酸和钙结合形成草酸钙结石。
痛风：痛风患者嘌呤代谢异常，尿酸生成增加，可导致尿酸盐结石的形成。
尿路感染：尿路感染可导致尿液中细菌、炎症细胞和代谢产物的增加，这些物质可能刺激肾脏和尿路黏膜，促进结石的形成。
9.药物因素：某些药物如磺胺类、抗生素、维生素C等，长期服用可能会导致肾结石的形成。
10.其他因素：
遗传因素：部分肾结石患者可能存在遗传因素，导致肾脏对草酸、钙等物质的代谢异常。
生活方式：长期缺乏运动、饮水不足、坐姿不当等生活方式也可能增加肾结石的发病风险。
环境因素：某些地区的环境中可能存在高浓度的草酸、钙等物质，也可能增加肾结石的发生率。