肾结石形成的原因较多，其中尿液中某些物质浓度过高是关键因素。比如尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等成分浓度过高，超过了尿液的溶解限度，就容易析出形成结晶，逐渐聚集成结石，据统计，约有80%的肾结石与尿液成分异常有关。
代谢异常导致
尿液中钙含量过高： 当身体钙代谢出现问题时，比如甲状旁腺功能亢进，会使血钙升高，进而导致尿钙排出增多。正常情况下，尿液中钙的排出量有一定范围，若长期超出这个范围，就容易形成钙盐结石。草酸摄入过多： 日常生活中，如果经常大量食用富含草酸的食物，像菠菜、草莓、巧克力等，体内草酸含量会升高，经过代谢后，尿液中草酸浓度也会随之增加，增加了草酸钙结石形成的风险。一般来说，每天草酸的摄入量最好控制在150毫克以内，若长期大量超标，就易引发问题。
泌尿系统相关因素
尿路感染： 泌尿系统发生感染时，细菌、脓块等会作为核心，让尿液中的矿物质围绕其沉积，从而形成结石。比如变形杆菌感染时，能分解尿素产生氨，使尿液碱化，促使磷酸镁铵和磷酸钙结石形成。尿路梗阻： 当尿路存在狭窄、肿瘤等情况时，尿液排出不畅，尿液中的成分就容易在局部沉积，时间久了便形成结石。例如输尿管狭窄的患者，尿液在输尿管内停留时间延长，晶体物质更容易沉积下来。
其他生活因素影响
饮水不足： 每天饮水量过少会使尿液浓缩，尿液中各种溶质的浓度相对升高，容易析出结晶形成结石。建议成年人每天的饮水量保持在2000 - 3000毫升以上，若饮水量长期低于1500毫升，患肾结石的风险会明显增加。饮食结构不合理： 除了草酸摄入过多，高动物蛋白、高糖饮食等也不利于健康。高动物蛋白饮食会使尿液中钙和尿酸含量增加，降低尿枸橼酸盐含量，增加结石形成几率；高糖饮食会促进肠道吸收钙，同时使尿钙排泄增加，容易形成结石。