脑栓塞的治疗需根据病情分阶段进行，一般在发病急性期要争分夺秒采取措施。首先，超早期（通常指发病4.5小时内）若符合溶栓指征，可考虑使用重组组织型纤溶酶原激活剂（rt-PA）进行静脉溶栓，能溶解血栓，恢复血流。
急性期的药物治疗
抗凝药物：发病后如果不适合溶栓，可能会使用抗凝剂，像肝素类药物可以防止血栓进一步扩大，但使用时需密切监测凝血功能。抗血小板聚集药物：常用的有阿司匹林等，能抑制血小板聚集，减少血栓形成风险，但要注意可能出现的出血等不良反应。
改善脑循环治疗
扩张血管药物：可以使用一些药物来扩张脑血管，增加脑血流量，比如前列地尔等，但使用时要谨慎评估患者的颅内压等情况。脑保护药物：像依达拉奉等，具有清除自由基、减轻脑缺血再灌注损伤的作用，有助于保护神经细胞。
康复治疗阶段
早期康复介入：一般在病情稳定后48 - 72小时就可以开始康复治疗，包括肢体的被动运动，防止肌肉萎缩和关节僵硬。比如让患者的肢体进行简单的屈伸等活动，每天可进行数次，每次10 - 15分钟左右。语言康复训练：如果患者有语言障碍，要进行针对性的语言康复训练，从简单的发音练习开始，逐步过渡到语句表达等。
病因治疗
查找栓子来源：要积极查找脑栓塞的栓子来源，比如如果是心源性栓子，可能需要对心脏疾病进行治疗，像心房颤动患者可能需要控制心律等。如果是大动脉粥样硬化导致的栓子，要针对动脉粥样硬化的危险因素进行干预，如控制高血压，一般要求血压控制在140/90mmHg以下（能耐受者可更低），控制高血脂，将血脂中的低密度脂蛋白胆固醇等控制在目标范围内等。同时要让患者戒烟限酒，养成健康的生活方式。