慢性气管炎的治疗药物需根据病情阶段等选择，一般急性发作期常使用抗感染药物等，缓解期注重增强免疫力等。比如急性发作期有细菌感染时可能用到抗生素等。
急性发作期常用药物
抗感染药物： 如果是细菌感染引起的慢性气管炎急性发作，常用的有阿莫西林克拉维酸钾等，这类药物能抑制细菌生长繁殖来控制感染。如果是支原体感染，可选用阿奇霉素，它能作用于支原体的核糖体，抑制其蛋白质合成。祛痰药物： 盐酸氨溴索是常用的祛痰药，它可以促进呼吸道黏膜浆液腺的分泌，减少黏液腺分泌，从而降低痰液黏度，促进肺表面活性物质的分泌，增加支气管纤毛运动，使痰液易于咳出。
缓解期常用药物
提高免疫力药物： 对于免疫力较低容易复发的慢性气管炎患者，可以使用胸腺肽肠溶片，它能调节和增强人体细胞免疫功能，促使T淋巴细胞成熟。还有卡介菌多糖核酸注射液，能通过调节机体的细胞免疫、体液免疫，激活单核 - 巨噬细胞功能，增强自然杀伤细胞功能来增强机体抗病能力。支气管扩张剂： 像沙丁胺醇气雾剂，在慢性气管炎缓解期如果有气道痉挛情况时可使用，它能选择性激动支气管平滑肌的β₂受体，使支气管平滑肌松弛，从而缓解支气管痉挛。
特殊人群用药注意
儿童患者： 儿童使用慢性气管炎药物需谨慎，比如抗感染药物中的抗生素，要避免使用不适合儿童的种类。在使用祛痰药时，剂量要严格按照儿童体重等计算，避免过量。老年患者： 老年慢性气管炎患者肝肾功能可能有所减退，在使用药物时要注意药物的代谢情况。比如使用一些经肝肾代谢的药物，要监测肝肾功能，根据情况调整用药剂量。而且老年患者可能同时患有其他疾病，用药时要注意药物之间的相互作用，避免产生不良反应。