脸颊两侧长小疙瘩的原因可能有以下几点：
1.痤疮：痤疮是一种常见的慢性炎症性皮肤病，好发于青少年，与雄激素水平增加、皮脂分泌增加、痤疮丙酸杆菌繁殖、毛囊皮脂腺导管角化异常等有关。痤疮可表现为粉刺、丘疹、脓疱、结节、囊肿等多种类型，常发于面部、前胸、后背等皮脂腺丰富的部位。如果脸颊两侧的小疙瘩是红色的，有压痛，可能是痤疮。
2.玫瑰痤疮：玫瑰痤疮是一种主要发生于面部中央的红斑和毛细血管扩张的慢性炎症性皮肤病，病因尚不明确，可能与遗传、神经血管调节功能异常、微生物感染、皮肤屏障功能受损、免疫炎症反应等有关。玫瑰痤疮可分为红斑毛细血管扩张型、丘疹脓疱型、鼻赘型和眼型四种类型，不同类型的症状有所不同。如果脸颊两侧的小疙瘩是对称性分布的，伴有毛细血管扩张，可能是玫瑰痤疮。
3.接触性皮炎：接触性皮炎是皮肤或黏膜接触某些外界物质后，在接触部位发生的炎症反应，病因主要有原发性刺激物和变态反应两种。原发性刺激物如强酸、强碱、芥子气、芥子油等，变态反应性物质如某些植物（漆树、荨麻、银杏等）、动物（动物毒素、昆虫分泌物等）、某些化学物质（镍、铬、汞等金属及其盐类）等。如果脸颊两侧的小疙瘩是接触某些物质后出现的，伴有瘙痒、红肿等症状，可能是接触性皮炎。
4.湿疹：湿疹是由多种内外因素引起的瘙痒剧烈的一种皮肤炎症反应，病因复杂，与遗传、免疫、环境、感染等因素有关。湿疹可分为急性、亚急性和慢性三期，不同期的症状有所不同。如果脸颊两侧的小疙瘩是对称性分布的，伴有渗出、结痂、脱屑等症状，可能是湿疹。
5.其他：脸颊两侧长小疙瘩还可能是其他原因引起的，如粟丘疹、皮脂腺异位症、痤疮样药疹、颜面播散性粟粒狼疮等。
如果脸颊两侧的小疙瘩持续不消退或加重，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持皮肤清洁，避免搔抓和挤压，避免使用刺激性的化妆品和护肤品，饮食清淡，避免食用辛辣、油腻、甜食等。