衣原体感染主要是由衣原体这种微生物引起的。衣原体有不同的血清型，不同血清型可导致不同部位的感染。比如沙眼衣原体的某些血清型可引起沙眼、泌尿生殖道感染等；肺炎衣原体可引起肺炎等。
性传播是重要原因之一
性接触传播： 在性活跃人群中，通过无保护的性行为，如阴道性交、肛门性交、口交等，衣原体很容易在性伴侣之间传播。有研究表明，在不洁性行为后，感染衣原体的风险会明显增加。比如在一些性传播疾病高发的人群中，衣原体感染的发生率相对较高。高危性行为人群： 有多个性伴侣、近期新换性伴侣的人群，感染衣原体的几率比单一固定性伴侣的人群要高很多。而且如果一方感染了衣原体，在未采取防护措施的情况下与另一方发生性行为，另一方被感染的概率较大。
母婴传播也是原因
分娩过程中的传播： 孕妇如果感染了衣原体，在分娩的时候，胎儿通过产道就有可能被感染。尤其是新生儿，很容易在通过产道时感染衣原体，从而引起新生儿结膜炎或者新生儿肺炎等疾病。比如在一些孕妇衣原体检测呈阳性的情况下，新生儿出现相关感染症状的概率会显著升高。垂直传播影响： 这种母婴传播是直接的垂直传播，胎儿在子宫内一般不会被感染，主要是在分娩过程中接触到被感染的产道分泌物而感染。所以对于孕妇来说，在孕期如果发现衣原体感染，需要及时进行干预治疗，以降低新生儿感染的风险。
密切接触也可导致感染
间接密切接触： 接触被衣原体污染的物品，比如共用毛巾、浴盆等。虽然这种传播方式的概率相对性传播和母婴传播较低，但在一些密闭、卫生条件差的环境中，也有可能发生。例如在一些集体生活的场所，如宿舍、宾馆等，如果有感染者使用过的物品没有经过彻底消毒，其他人接触后就有可能被感染。家庭密切接触： 在家庭中，如果有成员感染了衣原体，与其他家庭成员密切接触，也可能造成传播。比如家人之间共用生活用品等情况，就存在感染的风险。尤其是家中有儿童的情况下，儿童的抵抗力相对较弱，更容易通过密切接触被感染。