地图舌的病因目前尚不十分明确，可能与多种因素有关。一般认为，大约有10% - 20%的儿童可能会出现地图舌的情况。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 研究发现，地图舌具有一定的遗传易感性。如果家族中有亲属曾患地图舌，那么个体患地图舌的概率可能会相对较高。比如，父母一方患有地图舌，其子女患地图舌的几率比家族中无地图舌患者的家庭子女要高一些。基因相关： 目前虽然还没有完全明确具体是哪些基因导致，但从遗传学角度来看，基因的遗传背景在地图舌的发生中起到了一定作用。一些特定的基因变异可能会影响口腔黏膜的代谢等过程，从而增加患地图舌的风险。
免疫因素影响
免疫功能异常： 当人体的免疫功能出现紊乱时，可能会引发地图舌。例如，自身免疫性疾病患者相对更容易出现地图舌相关的口腔黏膜变化。免疫系统在维护口腔黏膜的正常结构和功能中起着重要作用，一旦免疫平衡被打破，就可能导致口腔黏膜出现像地图舌那样的异常表现。免疫反应参与： 机体的免疫反应会对口腔黏膜组织产生影响。在地图舌患者的病变部位，可能会检测到异常的免疫细胞浸润等免疫反应迹象，这表明免疫因素在地图舌的形成过程中起到了关键作用，免疫系统的异常激活或调节失常可能促使了地图舌的发生。
营养因素关联
维生素缺乏： 缺乏维生素B族等营养物质可能与地图舌有关。比如，维生素B2、维生素B6、维生素B12等对维持口腔黏膜的正常代谢非常重要。当人体长期摄入不足这些维生素时，口腔黏膜的修复和更新受到影响，就容易出现地图舌的症状。有研究显示，约30%左右的地图舌患者存在维生素B族缺乏的情况。微量元素缺乏： 锌等微量元素的缺乏也可能引发地图舌。锌在人体的生长发育、免疫功能等方面都有着重要作用，对口腔黏膜的健康也至关重要。当体内锌含量过低时，会影响口腔黏膜细胞的正常功能，导致黏膜出现病变，表现为地图舌。例如，一些偏食、挑食的儿童，由于营养摄入不均衡，容易出现锌等微量元素缺乏，进而增加地图舌的发病几率。