膝盖即膝关节，跑步时间长了膝关节疼，可能由以下原因导致：
一、乳酸堆积：若患者长时间未运动，突然过度跑步，会使肌肉进行无氧代谢从而产生乳酸，而乳酸的代谢就会引发局部的酸痛感。
二、滑膜炎：
1.多因跑步姿势不当、软骨退变等因素诱发，致使膝关节滑膜组织分泌大量滑液，还会出现滑膜组织异常增生的情况，进而引起膝关节疼痛、活动受限等症状。
三、膝关节损伤：
1.倘若患者跑步时运动量过大，可能造成膝关节韧带、半月板损伤，特别是在运动后期，肌肉力量不足会使膝关节骨胫受力增加，导致膝关节软骨出现磨损和损伤，可能引发膝关节滑膜急性炎症，使得膝关节产生疼痛。
四、髌骨软化症。
此外，还可能有其他原因。建议患者及时就医明确诊断，并在医生指导下积极治疗。总之，跑步后膝关节疼的原因多样，需仔细甄别，以便采取正确的应对措施。