肾阳虚多是由多种因素长期作用导致的，比如年龄增长，随着年龄增加，人体的肾阳会自然衰退，有研究显示，40岁以上人群肾阳虚的发生率会逐渐上升；还有久病伤肾，像一些慢性疾病如果长期不愈，会损耗肾阳，影响肾脏功能；另外，房劳过度也会伤及肾阳，频繁的性生活等会使肾脏阳气过度消耗。
先天禀赋不足
遗传因素影响： 如果父母体质较弱，肾阳亏虚，那么子女先天可能就会肾阳不足。比如家族中有多人有畏寒怕冷、腰膝酸软等肾阳不足的表现，后代患肾阳虚的几率相对会高一些。早产因素： 早产儿由于在母体内发育时间不够，脏腑功能相对未完善，肾阳也可能相对不足，出生后更容易出现肾阳虚的相关症状。
外邪侵袭
寒邪入侵： 长期处于寒冷潮湿的环境中，寒邪易侵入人体，损伤肾阳。例如在寒冷的冬天，不注意保暖，长时间待在阴冷的地方，寒邪就会从肌表侵犯人体，影响肾阳的功能。据统计，长期生活在寒冷地区的人群中，肾阳虚的患病率比生活在温暖地区的人群要高约20%。湿邪困阻： 湿邪重浊黏腻，容易阻碍阳气的运行。当人体长时间处于潮湿环境，或者本身脾胃功能虚弱，水湿运化失常，湿邪内生，进而影响肾阳。比如南方一些潮湿多雨的地区，当地居民患肾阳虚相关病症的比例相对较高。
饮食不节
过食生冷： 经常食用过多生冷寒凉的食物，如大量食用冰镇饮料、生冷瓜果等，会损伤人体阳气，其中也包括肾阳。长期大量吃生冷食物的人，更容易出现畏寒肢冷、腰膝冷痛等肾阳虚的症状。过度饮酒： 过量饮酒会损伤脾胃，进而影响肾阳的化生。酒精属于湿热之品，长期过量饮用，会生湿化热，损耗人体阳气，尤其是肾阳。有研究发现，长期酗酒者中，约30%存在不同程度的肾阳虚表现。