三个月宝宝嗓子有痰但不咳嗽，可能是以下原因引起的。
1.喉软骨发育不完善：宝宝喉部的甲状软骨和环状软骨发育不完善，会导致气道相对狭窄，呼吸时可能会出现呼噜呼噜的声音，这是一种正常的生理现象，通常会在宝宝长大一些后逐渐改善。
2.呼吸道感染：如果宝宝感染了病毒或细菌，可能会导致呼吸道炎症，从而引起咳嗽和咳痰。但在某些情况下，感染可能仅局限于喉部，导致嗓子有痰而不咳嗽。
3.过敏：宝宝对某些物质过敏，如尘螨、花粉、动物毛发等，可能会引起喉部炎症和分泌物增多，导致嗓子有痰。
4.胃食管反流：如果宝宝的胃食管反流，胃酸和胃内容物可能刺激喉部，导致咳嗽和咳痰。
5.环境因素：干燥的空气、烟雾、粉尘等环境因素可能刺激宝宝的喉部，导致分泌物增多。
对于三个月宝宝嗓子有痰但不咳嗽的情况，以下是一些建议。
1.观察宝宝的症状：密切观察宝宝的呼吸、体温、精神状态等，如果出现呼吸急促、呼吸困难、发热等异常症状，应及时就医。
2.保持室内空气湿润：可以使用加湿器增加室内空气湿度，有助于缓解喉部不适。
3.拍背排痰：将宝宝竖着抱起，空心掌轻轻拍打宝宝的背部，有助于促进痰液排出。
4.适当增加水分摄入：可以让宝宝多喝水或母乳，有助于稀释痰液。
5.避免刺激：尽量避免宝宝接触烟雾、粉尘等刺激性物质，保持室内清洁。
6.就医咨询：如果宝宝的症状持续不缓解或加重，或者出现其他异常症状，应及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。
需要注意的是，不要自行给宝宝使用药物，尤其是抗生素。因为咳嗽和咳痰可能是多种原因引起的，需要根据具体情况进行治疗。在医生的指导下使用药物可以确保宝宝的安全和有效治疗。