肛门疱疹的治疗方法包括消炎清洗、外用药物、口服药物等。具体如下：
一、消炎清洗：肛门疱疹往往因长期存在炎症感染而引发，很多患者会有局部瘙痒、疼痛、发热等表现。在治疗前，应先用温水或生理盐水对局部进行清洗，这样可以减轻肛门疱疹带来的不适。平时一定要注重局部卫生，勤换内衣以预防细菌感染。
1.温水清洗：温水可以起到一定的清洁和舒缓作用。
2.生理盐水清洗：有助于维持局部的生理环境。
二、外用药物：若因长期遭受病毒感染而导致肛门疱疹，其临床症状主要有局部疼痛、丘疹、水疱等。可外用阿昔洛韦软膏、复方磺胺氧化锌软膏、尿素软膏等涂抹在患处。
1.阿昔洛韦软膏：对病毒有抑制作用。
2.复方磺胺氧化锌软膏：能起到一定的抗菌消炎功效。
3.尿素软膏：可改善局部皮肤状况。
三、口服药物：肛门疱疹由单纯疱疹病毒Ⅱ型引起，也和免疫力低下有关，通常潜伏期约3至6个月，主要症状多为小水疱，严重时可形成溃疡。治疗时可选用更昔洛韦分散片、腺苷钴胺片、血府逐瘀胶囊等药物。
1.更昔洛韦分散片：主要用于抗病毒。
2.腺苷钴胺片：有助于营养神经等。
3.血府逐瘀胶囊：可起到一定的活血化瘀等作用。
总之，对于肛门疱疹需要根据具体情况选择合适的治疗方法，以缓解症状，促进康复。同时要注意提高自身免疫力，保持良好的生活习惯和卫生习惯。