孩子发烧39度却不咳嗽不流鼻涕，这通常是由感染导致的，常见的有上呼吸道感染、消化或泌尿系统感染等情况。需及时进行检查和对症治疗。
一、上呼吸道感染：
1.鼻炎或支气管炎可能引发孩子出现这种状况，同时扁桃体化脓或者淋巴结发炎也会如此。需要请专业医生进行查体，并化验血常规等以明确。
若有鼻塞、鼻黏膜充血等症状，可遵医嘱使用减充血剂来减轻鼻充血、鼻塞、打喷嚏等表现。
若有频繁打喷嚏、多量流涕等情况，可遵医嘱使用抗组胺药物如氯雷他定、西替利嗪进行治疗，同时配合使用镇咳、祛痰、解热镇痛类药物如右美沙芬、氨溴索、阿司匹林等。
二、消化或泌尿系统感染：
1.消化系统感染时，孩子会有发烧39度不咳嗽不流鼻涕的情况，还可能伴有腹痛、腹泻等症状。
若为消化系统感染，可通过化验大便常规协助诊断，应及时使用相关药物治疗，如胃肠遭受细菌感染，可遵医嘱使用诺氟沙星胶囊以及复方黄连素片。
2.泌尿系统感染时，也会出现这样的表现，且可出现尿频、尿急、尿痛等。
可根据孩子的症状进行区分，通过化验尿常规可协助诊断，针对不同情况进行治疗。如绝经前非妊娠妇女急性单纯性膀胱炎，可遵医嘱使用磷霉素、呋喃妥因等；妊娠期尿路感染，可根据实验室检查结果，遵医嘱使用如阿莫西林等。
总之，当孩子出现发烧39度但不咳嗽不流鼻涕的情况时，要及时明确原因，采取相应的治疗措施，以保障孩子的健康。