孩子发烧39度但不咳嗽不流鼻涕，这通常由感染引起，比如上呼吸道感染、消化或泌尿系统感染等都是常见因素，需尽快进行检查并对症治疗。
一、上呼吸道感染：
1.鼻炎或支气管炎可能引发孩子发烧39度却不咳嗽不流鼻涕，同时扁桃体化脓或淋巴结发炎也会出现此种情况。需要请专业医生进行查体，并化验血常规等。
(1)若有鼻塞、鼻黏膜充血等症状，可遵医嘱使用减充血剂，来减轻鼻充血、鼻塞、打喷嚏等表现。
(2)若有频繁打喷嚏、多量流涕等情况，可遵医嘱使用抗组胺药物治疗，如氯雷他定、西替利嗪等，同时配合使用镇咳、祛痰、解热镇痛类药物，如右美沙芬、氨溴索、阿司匹林等。
二、消化或泌尿系统感染：
1.消化系统感染时，也会出现孩子发烧39度不咳嗽不流鼻涕的状况，且会伴有腹痛、腹泻等症状。
(1)若是消化系统感染，通过孩子的这些症状可加以区分，化验大便常规可协助诊断，应及时使用相关药物治疗，比如胃肠遭受细菌感染，可遵医嘱使用诺氟沙星胶囊以及复方黄连素片。
2.泌尿系统感染时，会有尿频、尿急、尿痛等表现。
(1)通过这些症状可进行判断，化验尿常规可协助诊断，比如绝经前非妊娠妇女急性单纯性膀胱炎，可遵医嘱使用磷霉素、呋喃妥因等，而若是妊娠期尿路感染，可根据实验室检查结果，遵医嘱使用如阿莫西林等。
总之，当孩子出现这种情况时，要及时明确原因，采取针对性的治疗措施，以促进孩子尽快恢复健康。