胸腺瘤的临床症状多样，部分患者早期可能没有明显症状，多在体检时发现。而有症状的患者，常见的临床症状如下：
局部压迫相关症状
胸痛或胸部不适： 约30% - 60%的胸腺瘤患者会出现胸痛或胸部不适的症状，疼痛程度可轻可重，可为隐痛、胀痛等，这是因为肿瘤生长可能会对周围组织产生压迫或牵拉。例如肿瘤增大压迫胸膜或肋间神经时，胸痛症状可能会比较明显。咳嗽： 大约有10% - 20%的患者会出现咳嗽症状，多为刺激性干咳。这是由于肿瘤刺激气管或支气管引起的。如果肿瘤压迫支气管导致部分阻塞，还可能伴有咳痰等表现。
全身症状
重症肌无力： 约15% - 50%的胸腺瘤患者会合并重症肌无力。患者会出现肌肉无力的症状，常见的是眼外肌受累，表现为眼睑下垂、复视等；随着病情发展，可能会累及面部肌肉、吞咽肌、呼吸肌等，导致吞咽困难、声音嘶哑、呼吸困难等。例如患者可能会发现自己睁不开眼睛，或者吃饭时吞咽费力。单纯红细胞再生障碍性贫血： 比较少见，但也是胸腺瘤可能伴随的全身症状之一。患者会出现贫血相关表现，如面色苍白、乏力、头晕等，血常规检查可发现红细胞明显减少。
肿瘤侵犯周围组织引发的症状
上腔静脉综合征： 当胸腺瘤侵犯或压迫上腔静脉时，可出现上腔静脉综合征，表现为头面部、颈部和上肢水肿，颈部和胸部浅表静脉扩张等。这是因为上腔静脉回流受阻，血液淤积导致的。Horner综合征： 如果肿瘤侵犯交感神经链，可能会引起Horner综合征，出现同侧眼睑下垂、瞳孔缩小、眼球内陷、面部无汗等症状。