扁桃体红肿通常是由感染因素引起的，其中最常见的是病毒和细菌感染。比如，有超过90%的扁桃体红肿最初是由病毒感染导致的，像普通感冒病毒、EB病毒等都可能引发。而细菌感染中，A组乙型溶血性链球菌是较为常见的致病菌。
病毒感染引发
普通感冒病毒： 当人体免疫力下降时，普通感冒病毒容易侵袭扁桃体，引发扁桃体红肿。比如在秋冬季节，气温变化大，很多人容易感染普通感冒病毒，从而出现扁桃体红肿、疼痛，还可能伴有鼻塞、流涕等症状。EB病毒： EB病毒感染也常导致扁桃体红肿，这种情况在青少年中相对多见。感染EB病毒后，除了扁桃体红肿，还可能出现发热、咽痛、颈部淋巴结肿大等表现，有时还会伴有肝脾肿大。
细菌感染引发
A组乙型溶血性链球菌： 这是引起扁桃体细菌感染导致红肿的常见病菌。当人体抵抗力降低时，链球菌容易在扁桃体部位繁殖。患者会出现明显的扁桃体红肿、疼痛，甚至有脓性分泌物附着，同时可能伴有高热，体温可达到39℃以上，还可能出现头痛、乏力等全身症状。葡萄球菌： 葡萄球菌感染也可能造成扁桃体红肿，不过相对A组乙型溶血性链球菌来说发生率稍低。感染葡萄球菌引发的扁桃体红肿，症状表现与链球菌感染有相似之处，也会有红肿、疼痛等情况，但具体表现可能因个体差异略有不同。
其他因素影响
免疫力低下： 长期营养不良、过度劳累等会使人体免疫力低下，这样就更容易受到病原体侵袭，导致扁桃体红肿。例如一些长期从事高强度体力劳动且饮食不均衡的人，扁桃体红肿的发生率就可能相对较高。邻近器官炎症蔓延： 比如鼻腔、鼻窦的炎症，其病原体可能蔓延至扁桃体，引起扁桃体红肿。像鼻窦炎患者，如果炎症没有得到有效控制，炎症因子可能波及扁桃体，导致扁桃体出现红肿等炎症反应。