耳根后面长疙瘩且伴随疼痛的原因较多，常见的有耳后淋巴结肿大，也可能是皮脂腺囊肿，还有部分患者是耳后的纤维瘤。
一、耳后淋巴结肿大：淋巴结是身体免疫系统的一部分，当身体受到感染或其他刺激时，淋巴结可能会肿大和疼痛。耳后区域有丰富的淋巴结，当附近的组织，如头皮、耳部等发生感染或炎症时，可能会导致耳后淋巴结肿大和疼痛。
1.感染因素：如细菌、病毒、真菌等感染都可能引起。常见的有耳部感染、头皮感染、上呼吸道感染等。
2.其他因素：自身免疫性疾病、恶性肿瘤的转移等也可能导致耳后淋巴结肿大，但相对较少见。
二、皮脂腺囊肿：这是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀而形成的潴留性囊肿。其特点是缓慢增长的良性病变，囊内有白色豆渣样分泌物。
1.发病机制：多由于皮脂腺导管阻塞，导致皮脂腺分泌的皮脂不能正常排出，积聚在腺体内形成囊肿。
2.表现：通常表现为一个圆形或椭圆形的肿物，表面光滑，与皮肤粘连，可推动，合并感染时可出现红肿、疼痛。
三、耳后的纤维瘤：是由纤维组织增生形成的良性肿瘤。
1.病因：尚不明确，可能与遗传、局部刺激等因素有关。
2.症状：一般表现为局部的硬结，生长缓慢，通常无明显疼痛，除非受到压迫或刺激。
出现这种情况后需到耳鼻喉科就诊，建议做彩超检查，可初步判断疙瘩的大小、范围及临床性质，同时做血常规检测，以判断有无急性细菌感染发炎。在治疗方面，如果是急性细菌感染发炎导致的，需考虑用抗生素；如果只是单纯的淋巴结肿大，可考虑观察。
总之，耳根后长疙瘩伴疼痛的原因多样，明确诊断后需根据具体情况选择合适的治疗方法。