附睾囊肿是否影响生育不能一概而论，一般较小的附睾囊肿通常对生育影响不大，但较大的附睾囊肿可能会有一定影响。据临床观察，约有10% - 15%的附睾囊肿患者可能会出现生育相关问题。
囊肿大小与生育的关系
较小囊肿：如果附睾囊肿直径在1厘米以内，这种情况下对睾丸的生精功能和精子的输送通常影响较小，生育受影响的概率相对较低。因为较小的囊肿不会明显压迫附睾管等结构，精子能够正常产生和运输。较大囊肿：当附睾囊肿直径超过2厘米时，就有可能压迫附睾内的管道系统，影响精子的成熟、储存和运输。比如可能会导致附睾管堵塞，使精子无法顺利通过，从而降低受孕的几率。
囊肿位置对生育的影响
靠近附睾头部的囊肿：附睾头部主要是精子进入附睾的起始部位，若此处有囊肿，可能会影响精子刚进入附睾时的正常生理过程，对精子的后续成熟可能产生一定不良作用，进而影响生育。靠近附睾尾部的囊肿：附睾尾部是精子储存的重要部位，此处的囊肿如果较大，会干扰精子在尾部的储存环境，影响精子的活力和质量，从而对生育造成影响。
囊肿是否引起炎症对生育的影响
无炎症的囊肿：单纯的附睾囊肿，没有合并炎症时，只要囊肿不是很大，对生育的影响相对局限。因为没有炎症的干扰，精子的生成和运输相对较正常。合并炎症的囊肿：如果附睾囊肿合并了附睾炎等炎症，炎症会破坏附睾内的微环境，影响精子的存活和功能。炎症还可能导致附睾管进一步狭窄或堵塞，严重影响精子的输出，大大增加生育困难的风险。