患神经母细胞瘤的具体原因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。目前认为遗传因素在神经母细胞瘤的发病中起到一定作用，约有1% - 2%的神经母细胞瘤与遗传突变相关，比如一些特定基因的突变可能增加患病风险。
遗传因素方面
基因变异影响：某些特定的基因发生突变时，会增加患神经母细胞瘤的可能性。例如，N-myc基因的扩增在约20% - 30%的高危神经母细胞瘤患者中存在，N-myc基因扩增会导致细胞异常增殖，从而引发肿瘤。
胚胎发育过程异常
原始神经嵴细胞异常分化：在胚胎发育早期，原始神经嵴细胞正常情况下会分化为多种细胞类型，但如果这些原始神经嵴细胞出现异常分化，就可能发展成为神经母细胞瘤。在胚胎发育的关键阶段，受到一些未知因素干扰时，这种正常的分化过程被打乱，就为神经母细胞瘤的发生埋下隐患。
环境因素相关
孕期不良因素影响：母亲在孕期接触某些有害物质可能会增加胎儿患神经母细胞瘤的风险。比如孕期接触有机溶剂、农药等化学物质，这些化学物质可能通过胎盘影响胎儿的发育，干扰细胞的正常生长和分化，进而增加神经母细胞瘤的发病几率。不过目前关于环境因素与神经母细胞瘤的确切关联还在进一步研究中，但已有一些迹象表明环境因素可能是诱因之一。