玫瑰糠疹的病因目前尚未完全明确，但研究发现与多种因素相关。一般认为，病毒感染可能是引发玫瑰糠疹的重要原因之一，有研究显示约半数以上的玫瑰糠疹患者在发病前曾有上呼吸道感染史，比如柯萨奇B组病毒感染就可能与之有关。
病毒感染因素
柯萨奇病毒感染： 柯萨奇B组病毒感染被认为与玫瑰糠疹的发生密切相关。当人体感染这类病毒后，可能会引发免疫系统的反应，从而导致玫瑰糠疹的出现。据统计，相当比例的玫瑰糠疹患者在发病前存在柯萨奇病毒感染的情况。EB病毒感染： 也有研究提示EB病毒感染可能参与玫瑰糠疹的发病过程。EB病毒感染后，可引起机体免疫功能的改变，进而诱发玫瑰糠疹。不过具体的作用机制还在进一步的研究探索中。
免疫系统异常因素
细胞免疫反应： 玫瑰糠疹患者的免疫系统存在一定的异常。在皮损部位可以观察到T淋巴细胞的浸润，这表明细胞免疫在玫瑰糠疹的发病中起到了作用。机体的免疫细胞可能错误地攻击了自身的皮肤组织，导致玫瑰糠疹皮疹的出现。免疫调节失衡： 免疫系统中的各种细胞因子和免疫调节物质失衡也可能与玫瑰糠疹有关。例如，一些炎症因子的异常分泌可能会导致皮肤出现炎症反应，进而形成玫瑰糠疹的典型皮疹表现。
遗传因素
遗传易感性： 有研究发现，玫瑰糠疹具有一定的遗传易感性。如果家族中有玫瑰糠疹患者，那么其他家族成员患玫瑰糠疹的风险可能会相对增加。但具体的遗传方式还不十分明确，可能是多基因遗传等复杂的遗传模式。不过，遗传因素并不是唯一的致病因素，环境等其他因素也会参与其中。