生理性黄疸与病理性黄疸有明显区别。一般来说，足月儿生理性黄疸大多在出生后2-3天出现，4-5天达到高峰，黄疸值通常不超过12.9mg/dL，7-10天消退；早产儿出现时间稍晚，多在出生后3-5天出现，黄疸值不超过15mg/dL，消退时间较晚，可延长到3-4周。
出现时间与消退时间方面
生理性黄疸： 足月儿一般出生后2 - 3天出现黄疸，4 - 5天达到高峰，7 - 10天消退；早产儿出现时间稍晚，多在出生后3 - 5天出现，黄疸值不超过15mg/dL，消退时间较晚，可延长到3 - 4周。而且生理性黄疸程度相对较轻，不会对宝宝健康造成太大影响。病理性黄疸： 出现时间较早，可能在出生后24小时内就出现黄疸；消退时间较晚，或者黄疸消退后又再次出现；而且黄疸进展较快，每日血清胆红素升高超过5mg/dL。
黄疸程度方面
生理性黄疸： 血清胆红素值对于足月儿来说一般不超过12.9mg/dL，早产儿不超过15mg/dL。通常只是面部、颈部皮肤轻度黄染，然后可能会波及躯干、四肢，但一般情况良好。病理性黄疸： 血清胆红素值对于足月儿来说超过12.9mg/dL，早产儿超过15mg/dL；而且黄疸不仅仅局限于面部、颈部，可能会蔓延至全身，皮肤黄染颜色较深，呈现金黄色或橘黄色。
伴随症状方面
生理性黄疸： 宝宝一般精神状态较好，吃奶正常，没有其他不适症状。病理性黄疸： 可能会伴随一些异常症状，比如宝宝精神萎靡、嗜睡、拒奶，有的还可能出现抽搐、尖叫、拥抱反射减弱等情况。如果是溶血性黄疸，还可能伴有贫血、肝脾肿大等表现；如果是感染引起的病理性黄疸，可能会伴有发热等感染症状。