口腔溃疡的原因有多种，比如复发性阿弗他溃疡，据统计，约10% - 25%的人会受其困扰。
一、局部创伤因素
口腔内机械刺激： 牙齿的残冠、残根或者锐利的牙尖等，会不断摩擦口腔黏膜，从而引发口腔溃疡。比如长期存在的残根，就可能在同一个部位反复造成创伤，导致溃疡经久不愈。不良咬合关系： 不合适的咬合关系会使牙齿对口腔黏膜产生不正常的压力，时间长了也容易引起口腔溃疡。例如，牙齿排列不整齐，上下牙咬合时力量分布不均，就可能在某些部位的黏膜上造成损伤进而形成溃疡。
二、免疫系统因素
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，会错误地攻击自身的口腔黏膜组织，从而引发口腔溃疡。像白塞病患者，就会因为免疫系统异常出现反复发作的口腔溃疡，同时还可能伴有眼部、生殖器等部位的病变。免疫功能低下： 当人体的免疫功能降低时，比如患上某些全身性疾病、长期劳累、睡眠不足等情况，身体抵御病原体的能力下降，就更容易受到病菌的侵袭，进而引发口腔溃疡。例如，长期熬夜的人，其免疫功能会受到影响，相对来说更易出现口腔溃疡。
三、营养缺乏因素
维生素缺乏： 尤其是维生素B族（如B1、B2、B6、B12等）和维生素C缺乏时，容易导致口腔溃疡。比如长期偏食、饮食结构单一的人，很可能会缺乏这些维生素，从而增加口腔溃疡的发生风险。以维生素B2缺乏为例，会影响口腔黏膜的正常代谢，使得黏膜抵抗力下降，引发溃疡。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素的缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体多种酶的合成和代谢，缺乏锌会影响细胞的正常分裂和修复，导致口腔溃疡不易愈合；铁是合成血红蛋白的重要原料，缺铁会影响身体的造血功能和免疫功能，进而引发口腔溃疡。例如，素食者如果不注意补充锌和铁，就容易出现口腔溃疡问题。