睡醒头疼眼睛疼的原因包括生理因素、高血压、偏头痛等，治疗方法有一般治疗和药物治疗。具体如下：
一、生理因素：如果长时间过度疲劳或用脑过度，进而导致睡眠时间不足，就容易在睡醒后出现头疼、乏力、头晕等表现。对此，在生活中需要特别注重休息，保证有充足的睡眠时间。
二、高血压：高血压患者在情绪过度激动或者刚睡醒时，可能出现血流异常，引发脑供血不足，从而产生听力下降、头疼、眼花、晕厥等不适症状。可在医生指导下应用氨氯地平贝那普利片、厄贝沙坦片、赖诺普利片等药物进行治疗。
三、偏头痛：若家族中有人患有偏头痛，其子女可能因遗传因素，在劳累或长期饮用咖啡等情况下诱发偏头痛，通常会有头晕、眼睛疼、头疼等症状。这时需在医生指导下使用洛索洛芬钠片、佐米曲普坦片、尼美舒利胶囊等药物进行治疗。
此外，还可能与脑水肿有关。建议平时适当外出活动以放松压力，也可以加强运动来改善睡眠，在出现不适症状后要及时就医。
总之，当出现睡醒头疼眼睛疼的情况时，要综合考虑可能的原因，并根据具体情况选择合适的治疗方法。同时，要注意日常的生活习惯和健康管理，以促进身体的恢复和健康。