肾积水的治疗需根据病因、病情等综合判断，一般来说，解除梗阻是关键。比如因尿路结石导致的肾积水，若结石较小，可通过大量饮水等方式促进排出；而对于较为严重的情况，可能需要手术治疗。
病因明确型的治疗
结石引起的肾积水：
如果是尿路结石导致的肾积水，对于直径小于0.6厘米的光滑结石，可先尝试保守治疗。患者要增加饮水量，每天保证2000毫升以上的尿量，有助于小结石随尿液排出。但如果结石较大，如直径大于0.6厘米，可能需要进行体外冲击波碎石，利用高能冲击波聚焦后击碎结石，让其排出体外，通常一次碎石后需观察结石排出情况。
先天性肾盂输尿管连接部狭窄引起的肾积水：
对于这种情况，手术是主要的治疗方式。一般会采用肾盂成形术，通过重建肾盂输尿管连接部，恢复尿液的正常引流。手术通常在全身麻醉下进行，术后需要注意伤口的护理，一般住院时间在7 - 10天左右。
感染相关型的肾积水
伴有感染的肾积水：
当肾积水伴有感染时，首先要进行抗感染治疗。会根据尿液培养和药敏试验结果选择合适的抗生素，比如常用的有头孢菌素类药物。一般需要静脉使用抗生素1 - 2周，待感染控制后再考虑处理肾积水的原发病。在抗感染期间，患者要注意休息，增加营养摄入，提高自身抵抗力。
肿瘤导致的肾积水
肿瘤引起的肾积水：
如果是肿瘤导致的肾积水，需要根据肿瘤的性质、部位等采取相应的治疗。如果是良性肿瘤，如肾错构瘤，体积较小且无症状时可定期观察；若体积较大有压迫症状，则需要手术切除。如果是恶性肿瘤，如肾癌，通常需要进行肾癌根治术，切除患侧肾脏、肾周脂肪及区域淋巴结等。术后还可能需要根据情况进行辅助放疗、化疗等综合治疗。