急性胃肠炎常用的药物有止泻药、益生菌、解痉药等。一般来说，可根据症状选择合适药物缓解。
止泻药物选择
蒙脱石散：它能吸附肠道内的病菌和毒素，保护肠道黏膜。成人每次服用1袋（3克），一天3次。儿童按年龄服用，1岁以下每日1袋，分3次服；1 - 2岁每日1 - 2袋，分3次服；2岁以上每日2 - 3袋，分3次服。黄连素：具有一定的抗菌作用，对肠道细菌感染引起的急性胃肠炎导致的腹泻有一定疗效，成人一次0.1 - 0.3克，一天3次。
调节肠道菌群药物
双歧杆菌三联活菌胶囊：可以补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善肠道功能。一般成人一次2 - 4粒，一天2 - 3次，用温水送服。地衣芽孢杆菌活菌胶囊：主要用于治疗因肠道菌群失调引起的急、慢性腹泻等。成人一次2粒，一天3次；儿童剂量酌减，可服用半粒或遵医嘱。
解痉止痛药物
颠茄片：能解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解腹痛。成人一次1 - 2片，一天3次。但前列腺肥大、青光眼患者禁用。山莨菪碱片：也可缓解胃肠道痉挛引起的疼痛，成人一次5 - 10毫克，一天3次。有青光眼患者禁用。
抗感染药物使用
如果是细菌感染引起的急性胃肠炎，可考虑使用抗生素。比如诺氟沙星，适用于成人肠道感染，但18岁以下青少年、儿童禁用，因为可能影响软骨发育。对于敏感菌引起的肠道感染，成人常用量是一次0.2克，一天2次，疗程一般5 - 7天。不过，抗生素的使用需由医生根据病情判断是否需要，不能自行随意使用。