口腔溃疡的引发原因较多，其中约80%的复发性口腔溃疡与遗传因素有关，比如父母双方若都有复发性口腔溃疡，子女患病几率能达到50%~60%。
一、局部创伤因素
口腔内机械性损伤： 刷牙时用力过猛，或不小心咬到口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡。比如有些人刷牙特别用力，或者吃饭时狼吞虎咽，经常咬到腮帮子，就可能在相应部位长出口腔溃疡。牙齿刺激： 不合适的假牙、锐利的牙尖等，长期刺激口腔黏膜，也会导致口腔溃疡。例如佩戴的假牙与口腔贴合不好，或者牙齿有尖锐的边缘，就会反复摩擦口腔组织，引发溃疡。
二、免疫系统问题
免疫力下降时易发病： 当人体免疫力降低时，比如感冒、过度疲劳、睡眠不足等情况下，口腔内原本潜伏的病毒就可能活跃起来，引发口腔溃疡。像有些人一感冒，嘴里就容易长溃疡。自身免疫性疾病关联： 某些自身免疫性疾病，如白塞病，口腔溃疡是其常见症状之一。白塞病除了口腔溃疡外，还可能出现眼部病变、生殖器溃疡等症状。
三、营养缺乏因素
维生素缺乏： 缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、B6等，容易引发口腔溃疡。比如长期挑食、节食的人，很容易出现维生素摄入不足的情况，进而导致口腔溃疡。微量元素缺乏： 缺锌、铁等微量元素也与口腔溃疡的发生有关。例如儿童如果缺锌，就可能反复出现口腔溃疡，同时还可能伴有生长发育迟缓、食欲减退等表现。