慢粒白血病的发生与费城染色体密切相关，约95%的慢粒白血病患者体内存在费城染色体，它是由于9号染色体和22号染色体发生易位形成的。
遗传学因素
染色体异常： 费城染色体是慢粒白血病的重要遗传学标志。正常情况下，9号染色体上的原癌基因ABL与22号染色体上的BCR基因发生融合，形成BCR-ABL融合基因，该基因会编码产生异常的酪氨酸激酶，导致骨髓造血干细胞异常增殖，从而引发慢粒白血病。这种染色体的异常改变具有一定的遗传性倾向，但并非绝对会遗传给后代，只是携带这种染色体异常的人群患病风险相对增高。
环境因素
电离辐射： 长期接触较高剂量的电离辐射是引发慢粒白血病的环境风险因素之一。比如在核事故中暴露于大量电离辐射的人群，患慢粒白血病的几率会明显增加。研究表明，受到中等剂量（如1-10Gy）的电离辐射照射后，数年甚至数十年后可能会逐渐出现慢粒白血病的相关症状。化学物质接触： 长期接触某些化学物质也可能诱发慢粒白血病。例如长期接触苯及其衍生物的人群，患慢粒白血病的风险比普通人群高。像一些从事橡胶制造业、染料制造业等行业的工人，由于长期接触含苯的化学物质，患病风险会有所上升。不过，接触这些化学物质后并非一定会患上慢粒白血病，只是患病的可能性较一般人群增大。
其他因素
年龄因素： 慢粒白血病在各个年龄段都可能发生，但多见于中年人群，发病高峰年龄在45-50岁之间。儿童和青少年患慢粒白血病相对较少，但也有病例报道。随着年龄的增长，人体的细胞代谢、免疫功能等会发生变化，可能使得机体对致癌因素的易感性增加，从而更容易患上慢粒白血病。病毒感染： 虽然目前尚未明确特定病毒直接导致慢粒白血病，但有研究发现某些逆转录病毒可能与白血病的发生有关。不过，病毒感染引发慢粒白血病的具体机制还不十分清楚，需要进一步的科学研究来阐明。