卵巢囊肿是否需要手术不能一概而论，一般来说，直径小于5厘米且无明显症状的卵巢囊肿，约有1/4可能是生理性的，可先观察，3~6个月后复查B超，若囊肿消失则无需手术；但如果囊肿持续存在或直径大于5厘米，通常建议手术。
生理性囊肿情况
黄体囊肿： 女性排卵后形成黄体，有时会形成黄体囊肿，一般在月经来潮后可自行消失，通常无需手术干预，定期复查B超监测其变化即可。滤泡囊肿： 是最常见的生理性囊肿，多由卵泡不成熟或成熟后不排卵持续存在形成，多数可在2~3个月经周期内自行消退，一般也不需要手术治疗，定期随访观察。
病理性囊肿情况
子宫内膜异位囊肿： 属于病理性囊肿，若囊肿较大，有痛经进行性加重等症状，或影响生育等情况时，通常需要手术治疗。比如囊肿直径超过5厘米，且患者有明显的盆腔疼痛等不适，就可能需要通过手术来去除囊肿。赘生性囊肿： 像浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等，这类囊肿有恶变的可能，一旦发现，通常建议手术切除。一般无论囊肿大小，只要确诊为赘生性囊肿，多需尽早手术治疗。
特殊情况处理
绝经后女性卵巢囊肿： 绝经后女性出现卵巢囊肿，由于体内激素水平变化，此时卵巢囊肿恶变的风险相对较高，所以一旦发现，多建议手术切除，明确囊肿性质。合并急腹症的囊肿： 如果卵巢囊肿发生破裂、扭转等情况，会引起剧烈腹痛等急腹症表现，这种情况下需急诊手术，以免延误病情，导致更严重的后果，如卵巢缺血坏死等。