月经结束第三天，即月经干净第三天。一般来说，月经干净第三天通常不会怀孕，但也有特殊情况会导致怀孕。
一、一般不会怀孕。
1.许多女性平时的月经较为规律，周期大概是一个月左右。
2.在月经干净第三天的时候，往往还未进入排卵期。
3.此时即便同房且未采取避孕措施，精子进入女性体内，但等到排卵时，精子已萎缩并失去活性，不具备使卵子受精的能力，所以一般情况下不会怀孕。
二、少数情况下会怀孕。
1.这种情况常见于月经不规律的女性，其排卵期不固定。
2.有可能会在月经干净第三天时就发生排卵。
3.若此时没有避孕，就有可能形成受精卵，从而导致怀孕。
总之，月经干净第三天是否会怀孕不能一概而论，要根据女性的具体月经情况来判断。