一般来说，月经干净第三天同房怀孕的几率较小，但仍有可能怀孕。
以下是具体分析：
1.一般情况下，女性的排卵期是在下次月经来潮前的14天左右。而在月经刚结束的三天内，通常还处于安全期，此时女性的子宫内膜尚未完全修复，卵子也尚未成熟排出，所以怀孕的几率较小。
2.然而，每个女性的月经周期和排卵时间都可能有所不同，而且排卵也可能受到情绪、环境、健康状况等因素的影响而提前或推迟。因此，即使在安全期，也不能完全排除怀孕的可能。
3.此外，如果女性的月经周期不规律，或者存在其他影响排卵的因素，如多囊卵巢综合征、卵巢功能早衰等，那么安全期就可能不准确，怀孕的风险也会相应增加。
4.如果你不希望怀孕，建议在任何时候进行性生活时都采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药、宫内节育器等。这些方法可以有效地降低怀孕的风险，但也并非100%可靠，因此在使用时需要注意正确的使用方法和注意事项。
总之，虽然月经干净第三天同房怀孕的几率较小，但仍有可能怀孕。如果你对怀孕的风险比较担心，或者有其他相关的问题，建议咨询医生或专业的医疗机构，以获取更详细和个性化的建议。同时，也要注意保护自己的身体健康，避免不必要的性行为和性传播疾病的感染。