扁桃体发炎主要是由病原微生物感染引起，其中A组乙型溶血性链球菌是较为常见的致病菌，约10%-30%的扁桃体炎由其引发。
病原体感染因素
细菌感染： 除了A组乙型溶血性链球菌，葡萄球菌、肺炎链球菌等也可导致扁桃体发炎。比如肺炎链球菌感染，它会侵入扁桃体组织，引发炎症反应，使扁桃体出现红肿、疼痛等症状。病毒感染： 像EB病毒、鼻病毒、腺病毒等病毒感染也会引发扁桃体发炎。例如腺病毒感染，可导致扁桃体充血、肿大，同时可能伴有发热、咳嗽等症状，一般儿童感染此类病毒引发扁桃体炎的情况较为常见。
自身抵抗力因素
免疫力低下时易发病： 当人体过度疲劳、长期睡眠不足、营养不良等情况下，身体的免疫力会下降，此时就容易受到病原体的侵袭，从而引发扁桃体发炎。比如长期熬夜的人，其身体免疫力处于较低水平，相比作息规律的人更易患上扁桃体炎。儿童抵抗力相对较弱： 儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，抵抗力相对成年人较弱，所以儿童患扁桃体发炎的几率相对较高。尤其是3-10岁的儿童，扁桃体处于活跃期，更容易受到病原体感染而发炎。
环境因素影响
空气污染影响： 长期处于污染严重的环境中，空气中的有害颗粒、化学物质等会刺激扁桃体，降低扁桃体的防御能力，增加扁桃体发炎的风险。比如在工业污染严重的地区，居民患扁桃体发炎的概率可能会高于环境较好的地区。季节变化影响： 在季节更替的时候，气温变化较大，如果没有及时增减衣物，人体容易受凉，导致上呼吸道抵抗力下降，从而引发扁桃体发炎。例如秋冬季节交替时，气温忽高忽低，很多人就会因为受凉而患上扁桃体炎。