宝宝咳嗽耳朵疼，可能由生理性原因或病理性原因导致。生理性原因包括剧烈咳嗽牵扯神经以及咳嗽时呼吸道压力改变传导至耳朵部位等；病理性原因主要有呼吸道感染和中耳炎。
一、生理性原因
1.剧烈咳嗽时牵扯到神经，因为耳朵是咽部的邻近组织，所以会引发耳朵疼。
2.咳嗽时呼吸道压力发生变化，通过咽喉管传导至耳朵处，耳膜震动也会产生耳朵疼症状。
二、病理性原因
1.呼吸道感染：当发生呼吸道感染时，在咽喉管处会出现充血水肿、炎性渗出，这会致使中耳内气体不再与外界相通，耳腔内压力增加，进而引起宝宝咳嗽和耳朵疼。
2.中耳炎：宝宝咽鼓管发育不完善，处于水平位置且管腔较粗短，上呼吸道的咽喉部位通过咽鼓管与耳道相连通，若病原体入侵导致上呼吸道黏膜充血、水肿，就容易累及耳道形成中耳炎，使宝宝出现咳嗽和耳朵疼等表现。
在日常生活中，若发现宝宝有咳嗽和耳朵疼的情况，一定要及时到医院就诊，依据诊断结果做进一步处理。如果只是在咳嗽时感觉耳朵疼，而中耳没有发炎，那就需要及时控制上呼吸道感染症状，使用镇咳类药物来控制咳嗽，以防病情加重。若是有中耳炎，则要控制感染、改善中耳通气引流功能，避免鼓膜穿孔。
总之，对于宝宝咳嗽耳朵疼的情况，要明确原因，及时采取相应的治疗措施，以保障宝宝的健康。